ggplot2 ou la grammaire des graphiques sous R

• logiciel libre et gratuit
• multi-plateforme (Windows, MacOS, Linux)
• nombreuses fonctions d'import et d'export des données
• développement très actif (plus de 10 000 extensions)
• de plus en plus utilisé dans la communauté scientifique
• interface graphique la plus commune : RStudio
• rapports automatisés avec Rmarkdown
• interfaçage possible avec bases SQL
• serveurs de calcul en ligne (cf. https://r-tools.huma-num.fr)

R dispose d'un puissant moteur graphique interne.

Exemples en ligne : https://www.r-graph-gallery.com/

Fonctions graphiques de base :

• permettent de dessiner dans un graphique (ajout de points, segments, étiquettes…)
• mais fonctions peu intuitives
• la production d'un graphique complet nécessite pas mal d'étapes et de codes

Heureusement, il existe de nombreuses extensions graphiques pour R, dont (liste non exhaustive)

• lattice, particulièrement adapté à la visualisation de panels et de séries temporelles
• circlize pour les visualisations circulaires
• igraph ou DiagrammeR pour les réseaux
• LexisPlotR pour les diagramme de Lexis

• extension développée par Hadley Wickham
• met en œuvre la grammaire des graphiques théorisée par Leland Wilkinson
• est devenue en quelques années l’une des extensions R les plus utilisées
• appartient au tidyverse, un ensemble d'extensions dédiées à l'analyse de données